Mascot Distiller可将原始质谱数据处理为峰值列表(peak list)，用于数据库搜索。图形界面提供了一个简单易操作的数据浏览器，用户可以查看数据谱并生成峰值列表，数据可来自多种不同的质谱仪器。处理代码是以Windows COM库存储的，因此可被类似Mascot Daemon的程序调用，也可被您自己编写的程序调用。




Mascot Distiller通过将实验数据与理想同位素分布拟合来检测峰值。这种方法的优点在于：完整的实验结果都将得到拟合，而不仅仅是12C峰。电荷态是自行决定的，因此峰值列表中仅包含单同位素峰，甚至当信号噪声很强或是同位素分布未被解析时也能得到很好的结果。整个过程并不需要进行平滑处理。


Mascot Distiller 2.0包括一个快速的de novo测序算法，手动和自动标识序列标签，in silico蛋白酶解和肽段破碎，以及导入查看Mascot搜索结果等功能。





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